Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms