Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLCP48506 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLCP48506 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCLCP48506 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms