Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OTX2P32243 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms