Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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