Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XBP1P17861 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XBP1P17861 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms