Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLD1P28340 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms