RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCC9	O60706	1549 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		27.16	■■□□□ 1.94
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	27.03	■■□□□ 1.92
SELENBP1-208	ENST00000447402	NACAD	O15069	1562 aa		26.82	■■□□□ 1.88
SELENBP1-208	ENST00000447402	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		26.78	■■□□□ 1.88
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		26.74	■■□□□ 1.87
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		26.71	■■□□□ 1.87
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCRIB	Q14160	1630 aa		26.21	■■□□□ 1.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		26.15	■■□□□ 1.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	26.06	■■□□□ 1.76
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		25.98	■■□□□ 1.75
SELENBP1-208	ENST00000447402	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		25.93	■■□□□ 1.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	25.24	■■□□□ 1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		25.23	■■□□□ 1.63
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		25.15	■■□□□ 1.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	25.08	■■□□□ 1.6
SELENBP1-208	ENST00000447402	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		25.07	■■□□□ 1.6
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMARCA4	P51532	1647 aa		25.05	■■□□□ 1.6
SELENBP1-208	ENST00000447402	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		24.99	■■□□□ 1.59
SELENBP1-208	ENST00000447402	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		24.84	■■□□□ 1.57
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMARCA2	P51531	1590 aa		24.81	■■□□□ 1.56
SELENBP1-208	ENST00000447402	WIZ	O95785	1651 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCAPD3	P42695	1498 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SELENBP1-208	ENST00000447402	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	24.68	■■□□□ 1.54
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMGXB3	Q12766	1538 aa		24.63	■■□□□ 1.53
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	24.47	■■□□□ 1.51
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		24.22	■■□□□ 1.47
SELENBP1-208	ENST00000447402	NES	P48681	1621 aa		24.11	■■□□□ 1.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		24.09	■■□□□ 1.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		24.03	■■□□□ 1.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFTR	P13569	1480 aa		23.99	■■□□□ 1.43
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		23.92	■■□□□ 1.42
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERCC6	Q03468	1493 aa		23.91	■■□□□ 1.42
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		23.82	■■□□□ 1.4
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		23.79	■■□□□ 1.4
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRDM2	Q13029	1718 aa		23.79	■■□□□ 1.4
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		23.75	■■□□□ 1.39
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		23.62	■■□□□ 1.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	23.58	■■□□□ 1.37
SELENBP1-208	ENST00000447402	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	23.54	■■□□□ 1.36
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR62	O43379	1518 aa		23.49	■■□□□ 1.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCC8	Q09428	1581 aa		23.48	■■□□□ 1.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOPBP1	Q92547	1522 aa		23.46	■■□□□ 1.35
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		23.44	■■□□□ 1.34
SELENBP1-208	ENST00000447402	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	23.44	■■□□□ 1.34
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUX2	O14529	1486 aa		23.43	■■□□□ 1.34
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUX1	P39880	1505 aa		23.42	■■□□□ 1.34
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNJ1	O43426	1573 aa		23.32	■■□□□ 1.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOP2B	Q02880	1626 aa		23.29	■■□□□ 1.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		23.29	■■□□□ 1.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	23.29	■■□□□ 1.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		23.26	■■□□□ 1.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOGA1	O94964	1423 aa		23.24	■■□□□ 1.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM41	Q8WV44	630 aa		23.23	■■□□□ 1.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		23.23	■■□□□ 1.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT140	Q96RY7	1462 aa		23.21	■■□□□ 1.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	23.14	■■□□□ 1.3
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		23.14	■■□□□ 1.3
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	23.11	■■□□□ 1.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	23.1	■■□□□ 1.29
SELENBP1-208	ENST00000447402	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	23.06	■■□□□ 1.28	9e-9	■■■■■ 37.7
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		23.06	■■□□□ 1.28
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR97	A6NE52	1622 aa		23.01	■■□□□ 1.27
SELENBP1-208	ENST00000447402	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	23	■■□□□ 1.27
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		22.96	■■□□□ 1.27
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF27	Q86VH2	1401 aa		22.92	■■□□□ 1.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		22.91	■■□□□ 1.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIN2B	Q13224	1484 aa		22.9	■■□□□ 1.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBRM1	Q86U86	1689 aa		22.85	■■□□□ 1.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		22.84	■■□□□ 1.25
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBLN2	P98095	1184 aa		22.82	■■□□□ 1.24
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		22.82	■■□□□ 1.24
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		22.79	■■□□□ 1.24
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGF1R	P08069	1367 aa		22.78	■■□□□ 1.24
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	22.77	■■□□□ 1.23
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	22.76	■■□□□ 1.23
SELENBP1-208	ENST00000447402	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		22.7	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNJ2	O15056	1496 aa		22.69	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		22.69	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	EEA1	Q15075	1411 aa		22.69	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		22.67	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAMTS12	P58397	1594 aa		22.67	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		22.67	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHD1	O14646	1710 aa		22.65	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUL7	Q14999	1698 aa		22.64	■■□□□ 1.22
SELENBP1-208	ENST00000447402	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		22.63	■■□□□ 1.21
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIN2A	Q12879	1464 aa		22.59	■■□□□ 1.21
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		22.56	■■□□□ 1.2
SELENBP1-208	ENST00000447402	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		22.54	■■□□□ 1.2
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRX	Q9BXM0	1461 aa		22.53	■■□□□ 1.2
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP170	Q5SW79	1584 aa		22.46	■■□□□ 1.19
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUP160	Q12769	1436 aa		22.44	■■□□□ 1.18
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF21B	O75037	1637 aa		22.4	■■□□□ 1.18
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	22.39	■■□□□ 1.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms