Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVH48-1M5A8F1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVH48-1M5A8F1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms