Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ARF6P62330 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms