Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms