Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF4P48230 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms