RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222902.6

CCL24-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 24, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL24, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL24-201ENST00000222902 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.11■■■□□ 2.57
CCL24-201ENST00000222902 ABCC9O60706 1549 aa28.37■■■□□ 2.13
CCL24-201ENST00000222902 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.25■■■□□ 2.11
CCL24-201ENST00000222902 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.97■■□□□ 1.91
CCL24-201ENST00000222902 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.79■■□□□ 1.88
CCL24-201ENST00000222902 NACADO15069 1562 aa26.69■■□□□ 1.86
CCL24-201ENST00000222902 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.43■■□□□ 1.82
CCL24-201ENST00000222902 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
CCL24-201ENST00000222902 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
CCL24-201ENST00000222902 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.17■■□□□ 1.78
CCL24-201ENST00000222902 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.16■■□□□ 1.78
CCL24-201ENST00000222902 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
CCL24-201ENST00000222902 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.76■■□□□ 1.71
CCL24-201ENST00000222902 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CCL24-201ENST00000222902 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.69■■□□□ 1.7
CCL24-201ENST00000222902 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.62■■□□□ 1.69
CCL24-201ENST00000222902 SCRIBQ14160 1630 aa25.58■■□□□ 1.69
CCL24-201ENST00000222902 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CCL24-201ENST00000222902 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.93■■□□□ 1.58
CCL24-201ENST00000222902 CUX2O14529 1486 aa24.71■■□□□ 1.55
CCL24-201ENST00000222902 NCAPD3P42695 1498 aa24.58■■□□□ 1.52
CCL24-201ENST00000222902 ERCC6Q03468 1493 aa24.57■■□□□ 1.52
CCL24-201ENST00000222902 HMGXB3Q12766 1538 aa24.47■■□□□ 1.51
CCL24-201ENST00000222902 SMARCA2P51531 1590 aa24.45■■□□□ 1.5
CCL24-201ENST00000222902 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.45■■□□□ 1.5
CCL24-201ENST00000222902 SMARCA4P51532 1647 aa24.41■■□□□ 1.5
CCL24-201ENST00000222902 NESP48681 1621 aa24.26■■□□□ 1.47
CCL24-201ENST00000222902 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CCL24-201ENST00000222902 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CCL24-201ENST00000222902 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCL24-201ENST00000222902 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.2■■□□□ 1.47
CCL24-201ENST00000222902 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.17■■□□□ 1.46
CCL24-201ENST00000222902 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.08■■□□□ 1.44
CCL24-201ENST00000222902 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.96■■□□□ 1.43
CCL24-201ENST00000222902 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.94■■□□□ 1.42
CCL24-201ENST00000222902 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.81■■□□□ 1.4
CCL24-201ENST00000222902 WDR62O43379 1518 aa23.79■■□□□ 1.4
CCL24-201ENST00000222902 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.78■■□□□ 1.4
CCL24-201ENST00000222902 WIZO95785 1651 aa23.66■■□□□ 1.38
CCL24-201ENST00000222902 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.64■■□□□ 1.38
CCL24-201ENST00000222902 TRIM41Q8WV44 630 aa23.64■■□□□ 1.37
CCL24-201ENST00000222902 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.55■■□□□ 1.36
CCL24-201ENST00000222902 CFTRP13569 1480 aa23.47■■□□□ 1.35
CCL24-201ENST00000222902 PRDM2Q13029 1718 aa23.42■■□□□ 1.34
CCL24-201ENST00000222902 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCL24-201ENST00000222902 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCL24-201ENST00000222902 OSCARQ8IYS5 282 aa23.35■■□□□ 1.33
CCL24-201ENST00000222902 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CCL24-201ENST00000222902 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.24■■□□□ 1.31
CCL24-201ENST00000222902 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.24■■□□□ 1.31
CCL24-201ENST00000222902 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.24■■□□□ 1.31
CCL24-201ENST00000222902 IFT140Q96RY7 1462 aa23.17■■□□□ 1.3
CCL24-201ENST00000222902 ARHGEF11O15085 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
CCL24-201ENST00000222902 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCL24-201ENST00000222902 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCL24-201ENST00000222902 TOPBP1Q92547 1522 aa23.08■■□□□ 1.28
CCL24-201ENST00000222902 ABCC8Q09428 1581 aa23.03■■□□□ 1.28
CCL24-201ENST00000222902 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.02■■□□□ 1.28
CCL24-201ENST00000222902 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.01■■□□□ 1.27
CCL24-201ENST00000222902 CHD1O14646 1710 aa23■■□□□ 1.27
CCL24-201ENST00000222902 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCL24-201ENST00000222902 ARAP1Q96P48 1450 aa22.84■■□□□ 1.25
CCL24-201ENST00000222902 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
CCL24-201ENST00000222902 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCL24-201ENST00000222902 WDR97A6NE52 1622 aa22.79■■□□□ 1.24
CCL24-201ENST00000222902 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.78■■□□□ 1.24
CCL24-201ENST00000222902 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 FBLN2P98095 1184 aa22.67■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 SYNJ1O43426 1573 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCL24-201ENST00000222902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCL24-201ENST00000222902 SOGA1O94964 1423 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL24-201ENST00000222902 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
CCL24-201ENST00000222902 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCL24-201ENST00000222902 GRIN2BQ13224 1484 aa22.55■■□□□ 1.2
CCL24-201ENST00000222902 PBRM1Q86U86 1689 aa22.55■■□□□ 1.2
CCL24-201ENST00000222902 CUX1P39880 1505 aa22.53■■□□□ 1.2
CCL24-201ENST00000222902 SYNJ2O15056 1496 aa22.53■■□□□ 1.2
CCL24-201ENST00000222902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CCL24-201ENST00000222902 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.42■■□□□ 1.18
CCL24-201ENST00000222902 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
CCL24-201ENST00000222902 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL24-201ENST00000222902 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCL24-201ENST00000222902 ADAMTS12P58397 1594 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL24-201ENST00000222902 GRIN2AQ12879 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL24-201ENST00000222902 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.23■■□□□ 1.15
CCL24-201ENST00000222902 CEP170Q5SW79 1584 aa22.22■■□□□ 1.15
CCL24-201ENST00000222902 SHROOM2Q13796 1616 aa22.22■■□□□ 1.15
CCL24-201ENST00000222902 NUP160Q12769 1436 aa22.21■■□□□ 1.15
CCL24-201ENST00000222902 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
CCL24-201ENST00000222902 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CCL24-201ENST00000222902 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.15■■□□□ 1.14
CCL24-201ENST00000222902 TOP2BQ02880 1626 aa22.13■■□□□ 1.13
CCL24-201ENST00000222902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL24-201ENST00000222902 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL24-201ENST00000222902 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.98■■□□□ 1.11
CCL24-201ENST00000222902 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCL24-201ENST00000222902 MAPKBP1O60336 1514 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms