Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXTL3O43909 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms