Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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