Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms