Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.113e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 OPN3-203ENST00000463155 806 ntTSL 36.66□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.43e-14■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 319.82■□□□□ 0.769e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.439e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.59e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 511.22□□□□□ -0.619e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 27.01□□□□□ -1.296e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.015e-20■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.15e-20■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-204ENST00000454791 1831 ntTSL 224.76■■□□□ 1.553e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.493e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.973e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-207ENST00000468304 803 ntTSL 212.82□□□□□ -0.363e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RHBDD2-206ENST00000467406 636 ntTSL 29.53□□□□□ -0.883e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 515.59■□□□□ 0.098e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 XPO6-202ENST00000561488 638 ntTSL 213.72□□□□□ -0.218e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 511.66□□□□□ -0.548e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 XPO6-210ENST00000566175 248 ntTSL 36.03□□□□□ -1.448e-10■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.518e-9■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 PTP4A1-207ENST00000639568 532 ntTSL 510.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.299e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TRIM14-206ENST00000478530 982 ntTSL 521.3■■□□□ 19e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.949e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.089e-7■□□□□ 9.7
PCBP2Q15366 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-216ENST00000489707 1935 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.052e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-7■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 SP2-204ENST00000637314 531 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RSPRY1-208ENST00000564435 743 ntTSL 519.74■□□□□ 0.752e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 GRB2-207ENST00000577711 555 ntTSL 219.05■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RSPRY1-206ENST00000562959 548 ntTSL 418.52■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 GAA-204ENST00000570803 956 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RSPRY1-204ENST00000562439 692 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PUF60-218ENST00000531995 631 ntTSL 317.74■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-12■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-204ENST00000518471 790 ntTSL 417■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RSPRY1-210ENST00000566352 1241 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.272e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-209ENST00000522255 931 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-211ENST00000523958 2026 ntTSL 216.27■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 SIPA1L1-207ENST00000554874 2106 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-215ENST00000558914 2342 ntTSL 215.52■□□□□ 0.072e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 RSPRY1-211ENST00000568505 654 ntTSL 515.14■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 C20orf194-202ENST00000619760 2151 ntTSL 214.75□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.085e-12■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ANO9-204ENST00000525857 466 ntTSL 414.44□□□□□ -0.12e-8■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 GAA-209ENST00000577106 812 ntTSL 314.05□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-208ENST00000521321 579 ntTSL 414□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 TRIM50-204ENST00000493498 555 ntTSL 412.94□□□□□ -0.345e-12■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 BFAR-210ENST00000566520 1177 ntTSL 212.94□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 NOMO1-204ENST00000566823 1898 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-16■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-218ENST00000559144 1011 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PPP2R2A-223ENST00000524169 784 ntTSL 312.66□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-212ENST00000558624 2627 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 PRMT2-213ENST00000486520 4031 ntTSL 212.44□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-201ENST00000326009 2570 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.422e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-205ENST00000557802 4202 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.432e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-8■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 BFAR-202ENST00000562121 723 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 TNRC6A-205ENST00000464539 1853 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.622e-10■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-21■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9.6
PCBP2Q15366 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9.6
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