Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms