Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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SRRM5B3KS81 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SRRM5B3KS81 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SRRM5B3KS81 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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