Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms