Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC2Q9Y235 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC2Q9Y235 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC2Q9Y235 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms