Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
APOBEC2Q9Y235 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
APOBEC2Q9Y235 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
APOBEC2Q9Y235 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
APOBEC2Q9Y235 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
APOBEC2Q9Y235 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
APOBEC2Q9Y235 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
APOBEC2Q9Y235 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
APOBEC2Q9Y235 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
APOBEC2Q9Y235 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
APOBEC2Q9Y235 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
APOBEC2Q9Y235 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
APOBEC2Q9Y235 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
APOBEC2Q9Y235 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
APOBEC2Q9Y235 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
APOBEC2Q9Y235 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
APOBEC2Q9Y235 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
APOBEC2Q9Y235 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
APOBEC2Q9Y235 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
APOBEC2Q9Y235 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
APOBEC2Q9Y235 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
APOBEC2Q9Y235 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
APOBEC2Q9Y235 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
APOBEC2Q9Y235 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
APOBEC2Q9Y235 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC2Q9Y235 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
APOBEC2Q9Y235 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APOBEC2Q9Y235 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
APOBEC2Q9Y235 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC2Q9Y235 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APOBEC2Q9Y235 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APOBEC2Q9Y235 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APOBEC2Q9Y235 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
APOBEC2Q9Y235 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
APOBEC2Q9Y235 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
APOBEC2Q9Y235 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
APOBEC2Q9Y235 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
APOBEC2Q9Y235 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
APOBEC2Q9Y235 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
APOBEC2Q9Y235 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
APOBEC2Q9Y235 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
APOBEC2Q9Y235 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
APOBEC2Q9Y235 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
APOBEC2Q9Y235 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
APOBEC2Q9Y235 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
APOBEC2Q9Y235 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APOBEC2Q9Y235 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOBEC2Q9Y235 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APOBEC2Q9Y235 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APOBEC2Q9Y235 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
APOBEC2Q9Y235 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
APOBEC2Q9Y235 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
APOBEC2Q9Y235 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APOBEC2Q9Y235 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC2Q9Y235 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBEC2Q9Y235 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC2Q9Y235 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOBEC2Q9Y235 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOBEC2Q9Y235 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBEC2Q9Y235 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBEC2Q9Y235 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APOBEC2Q9Y235 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APOBEC2Q9Y235 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APOBEC2Q9Y235 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APOBEC2Q9Y235 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC2Q9Y235 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC2Q9Y235 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC2Q9Y235 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC2Q9Y235 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC2Q9Y235 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC2Q9Y235 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC2Q9Y235 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC2Q9Y235 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
APOBEC2Q9Y235 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC2Q9Y235 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC2Q9Y235 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC2Q9Y235 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC2Q9Y235 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC2Q9Y235 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC2Q9Y235 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC2Q9Y235 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC2Q9Y235 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC2Q9Y235 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC2Q9Y235 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC2Q9Y235 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC2Q9Y235 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms