Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARHL2Q9NY43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARHL2Q9NY43 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms