Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF8

ZDHHC7, Palmitoyltransferase ZDHHC7, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC7Q9NXF8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC7Q9NXF8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC7Q9NXF8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC7Q9NXF8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms