Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM49BQ9NUQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM49BQ9NUQ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms