Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNK9Q9NPC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms