Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE7BQ9NP56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE7BQ9NP56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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