Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNPO2LQ9H987 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNPO2LQ9H987 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNPO2LQ9H987 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms