Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAGR1Q9BTK6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms