Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZKSCAN3Q9BRR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZKSCAN3Q9BRR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZKSCAN3Q9BRR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms