Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH3Q8TE77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH3Q8TE77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSH3Q8TE77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms