Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA5Q8N114 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA5Q8N114 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA5Q8N114 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA5Q8N114 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHISA5Q8N114 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHISA5Q8N114 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms