Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC13Q8IYE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC13Q8IYE1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms