Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF3Q86WH2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF3Q86WH2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms