Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms