Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2Z9

CENPQ, Centromere protein Q, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPQQ7L2Z9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPQQ7L2Z9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPQQ7L2Z9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms