Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM200BQ69YZ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM200BQ69YZ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms