Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF648Q5T619 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms