Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COLEC12Q5KU26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COLEC12Q5KU26 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms