Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms