Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA6Q15825 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA6Q15825 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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