Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEC23AQ15436 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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