Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)7.19□□□□□ -1.261e-17■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 TFRC-211ENST00000475593 875 ntTSL 36.31□□□□□ -1.48e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-9■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 526.74■■□□□ 1.872e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.742e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-10■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-10■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-16■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-16■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-16■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 59.29□□□□□ -0.924e-16■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 CCT2-211ENST00000550653 567 ntTSL 25.54□□□□□ -1.524e-16■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLC16A1-204ENST00000458229 2201 ntTSL 221.24■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.191e-323■■■□□ 17.3
NOLC1Q14978 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-11■■■□□ 17.2
NOLC1Q14978 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-11■■■□□ 17.2
NOLC1Q14978 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-11■■■□□ 17.2
NOLC1Q14978 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 26.67□□□□□ -1.343e-11■■■□□ 17.2
NOLC1Q14978 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 316.15■□□□□ 0.181e-323■■■□□ 17.2
NOLC1Q14978 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 213.5□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-7■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.112e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.052e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-213ENST00000530542 905 ntTSL 56.27□□□□□ -1.412e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 56.27□□□□□ -1.412e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-220ENST00000532603 566 ntTSL 46.19□□□□□ -1.422e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 55.61□□□□□ -1.512e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-207ENST00000526961 802 ntTSL 55.08□□□□□ -1.62e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-222ENST00000534375 390 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.682e-8■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.44e-14■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-14■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 DNAJC16-205ENST00000475133 6299 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.244e-14■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.274e-14■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.414e-14■■■□□ 17.1
NOLC1Q14978 GCN1-204ENST00000548132 498 ntTSL 313.65□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.032e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-207ENST00000490569 1802 ntTSL 59.27□□□□□ -0.932e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 36.26□□□□□ -1.412e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-62■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.912e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 426.73■■□□□ 1.875e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 526.73■■□□□ 1.875e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 226.39■■□□□ 1.822e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-212ENST00000493483 760 ntTSL 325.9■■□□□ 1.742e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)25.77■■□□□ 1.725e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-206ENST00000467894 1466 ntTSL 525.28■■□□□ 1.642e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 425.21■■□□□ 1.635e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 525.07■■□□□ 1.65e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.55e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 222.43■■□□□ 1.185e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 521.61■■□□□ 1.055e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.875e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 217.68■□□□□ 0.425e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-8■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.365e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.325e-10■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 PHC2-211ENST00000486897 547 ntTSL 511.23□□□□□ -0.612e-17■■■□□ 17
NOLC1Q14978 TM4SF1-203ENST00000493298 702 ntTSL 49.8□□□□□ -0.849e-8■■■□□ 17
NOLC1Q14978 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.979e-8■■■□□ 17
NOLC1Q14978 TM4SF1-204ENST00000493348 976 ntTSL 28.91□□□□□ -0.989e-8■■■□□ 17
NOLC1Q14978 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 514.11□□□□□ -0.151e-9■■■□□ 17
NOLC1Q14978 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-9■■■□□ 17
NOLC1Q14978 DDX39B-216ENST00000462421 618 ntTSL 39.81□□□□□ -0.841e-9■■■□□ 17
NOLC1Q14978 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 59.23□□□□□ -0.931e-9■■■□□ 17
NOLC1Q14978 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-12■■■□□ 17
NOLC1Q14978 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 219.68■□□□□ 0.743e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 314.99□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 16.9
NOLC1Q14978 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-6■■■□□ 16.9
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 48.3 ms