Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN3Q13033 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRN3Q13033 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRN3Q13033 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms