Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELLP55199 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELLP55199 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELLP55199 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELLP55199 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELLP55199 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELLP55199 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELLP55199 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELLP55199 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms