Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPP55072 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPP55072 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCPP55072 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCPP55072 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VCPP55072 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VCPP55072 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VCPP55072 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VCPP55072 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VCPP55072 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VCPP55072 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPP55072 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPP55072 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPP55072 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPP55072 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPP55072 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPP55072 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPP55072 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPP55072 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPP55072 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPP55072 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms