Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGRP47804 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGRP47804 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGRP47804 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGRP47804 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGRP47804 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGRP47804 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGRP47804 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGRP47804 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGRP47804 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGRP47804 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGRP47804 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGRP47804 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGRP47804 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGRP47804 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGRP47804 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGRP47804 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGRP47804 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGRP47804 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms