Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF4P34130 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF4P34130 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF4P34130 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTF4P34130 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTF4P34130 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF4P34130 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF4P34130 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF4P34130 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF4P34130 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF4P34130 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF4P34130 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTF4P34130 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF4P34130 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms