Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNCP24821 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNCP24821 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNCP24821 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNCP24821 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNCP24821 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNCP24821 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNCP24821 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNCP24821 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNCP24821 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms