Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDRP11473 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDRP11473 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDRP11473 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDRP11473 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDRP11473 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDRP11473 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDRP11473 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDRP11473 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDRP11473 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDRP11473 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDRP11473 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDRP11473 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VDRP11473 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VDRP11473 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VDRP11473 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VDRP11473 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDRP11473 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDRP11473 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms