Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHV1-8P0DP01 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms